影片《秘密暗线》讲述国民党陕军某部少校、中共地下党员冯智，在中共地下党组织和游击队的配合下，剿灭土匪，打击敌特，克服重重困难，在大巴山地区建立了秘密交通线，并通过交通线给陕南川北苏区和红四方面军运送了大量物资的故事。