梁永军、司文斌、周瑞麒三名生长环境、心态完全不同的90后，聚集在极限训练的山地部队。为锤炼山地旅，特种大队副大队长李铁率队扮演武装匪徒，进行实战化的演习。梁永军凭着过硬的素质，得到侦察连连长肖军认可，被调到了侦察连，和司文斌、周瑞麒等士兵组建全数字化特战分队。在侦察连，梁永军意外与前来代职的前女友林雨青重逢。在艰苦的训练中，梁永军与司文斌、周瑞麒等士兵建立了深厚友谊。大演习中，梁永军骄傲轻敌，山地旅遭受建旅以来的第一次大败。旅长在旅大院建起一堵耻辱墙。梁永军等人克服困难，快速成长。

《士兵突击》第二季将是一场挑选未来优秀指挥官的超级竞赛。节目延续第一季节目青春励志的纪实风格，从武警警官学院数千名年轻才俊中挑选出120名学员，将历经“极限72小时”魔鬼训练、分组协作PK、指挥对抗等层层考验，最终选拔出1名体能、心理、技能、谋略均属顶尖的优秀指挥官“潜龙”，并由学院授予至高荣誉。