故事发生在日本的一个海滨小城，九年级的女生斋藤一美拥有一个大家庭，全家以开拉面店为生。一天，班上来了一名转校生斋藤一夫。一美突然发现对方正是自己失散多年的童年玩伴。为了帮助一夫回忆起童年往事，一美带他来到了两人曾一起玩耍的山泉边，不料两人不慎失足掉入水中，两人的灵魂阴差阳错地进入了对方的身...

性格内向朋友极少的高中生莫予甜遇见了两个外星人炎恩俊和穆赫，他们是势不两立的亲兄弟为了争夺勿入莫予甜身体的能量石成为了她班级里的转校生，在保护莫予甜的过程中，他们渐渐喜欢上了善良的莫予甜，在与炎恩俊和穆赫的相处中莫予甜慢慢的融入班级，变得乐观自信起来。这时炎恩俊莫名其妙的成为雷欣儿的未婚夫，接着莫予甜和雷欣儿一起被绑架，充满青春味道的校园被人类的阴谋笼罩着。

由河森正治担任原案与监督的《创圣的大天使》系列新作《创圣EVOL》，是以前作故事过了1万2千年后的未来世界作为舞台，全新登场的角色将会搭乘新型的机械天使，与来自异次元的敌人们作战，本作中舞台所在的街道是以未来的香港为概念进行设计。